НДС могут начислять сверх предельной цены на лекарства в Казахстане Атамекен

В Астане на заседании проектного офиса по внедрению норм нового Налогового кодекса разъяснили право начислять НДС сверх предельной цены на лекарства. Предельную цену назвали верхним допустимым порогом, а не финальной стоимостью, сообщает Национальная палата предпринимателей "Атамекен".

"Учитывая, что предельная цена является лишь "верхним допустимым порогом", фактическая цена реализации может включать налог в соответствии с налоговым законодательством", – говорится в сообщении.

На заседании проектного офиса также рассмотрели вопросы, связанные с применением норм в сфере здравоохранения, включая таможенные процедуры и начисление НДС на препараты.

Отдельно обсудили ввоз медикаментов. Заместитель председателя НПП "Атамекен" Тимур Жаркенов заявил, что таможенные органы начали запрашивать подтверждение целевого назначения на лекарственные средства, включая те, что поставляются в рамках гарантированного объёма бесплатной медпомощи (ГОБМП) и обязательного соцмедстрахования (ОСМС). Он отметил, что такая практика не предусмотрена для всех категорий ввозимых препаратов.

Заместитель председателя Комитет государственных доходов Жаныбек Нуржанов пояснил, что обязательными условиями при импорте всех лекарственных средств являются наличие лицензии на фармацевтическую или медицинскую деятельность, а для лекарств, поставляемых по госзаказу, – договоры поставки в рамках ГОБМП/ОСМС и обязательства поставщика о целевом использовании товаров. Он также уточнил, что подтверждение целевого назначения требуется при импорте лекарственных субстанций и балк-продуктов, используемых для производства. Для готовых лекарств, как пояснили на заседании, достаточно стандартного пакета документов, включая лицензию и регистрацию или разрешение Министерства здравоохранения РК.

По итогам дискуссии решили внести изменения в правила и оперативно разослать инструкции в территориальные департаменты таможни.

Второй блок вопросов касался налоговых льгот. В "Атамекене" сообщили, что аптеки зачастую отказываются закупать препараты для лечения орфанных и социально значимых заболеваний. Причину назвали "налоговым диссонансом": поставщики применяют ставки НДС 5 и 16%, хотя по закону такие препараты должны быть освобождены от НДС на всех этапах реализации. По инициативе Нацпалаты Комитет медфармконтроля совместно с Комитетом государственных доходов, как сообщили в "Атамекене", в кратчайшие сроки выработают единую позицию, которая позволит вернуть льготные лекарства в широкую розницу.

По данным Минздрава, с 1 января 2026 года в Казахстане от НДС освободили медуслуги и лекарственные препараты, предоставляемые в рамках ГОБМП и ОСМС. В ведомстве также сообщали, что от НДС при оптовой и розничной реализации освобождаются препараты для лечения орфанных и социально значимых заболеваний. Одновременно в новом Налоговом кодексе предусмотрена пониженная ставка НДС при реализации лекарственных средств и медицинских изделий в оптовом и розничном сегментах: с января 2026 года – 5%, с 1 января 2027 года – 10%.

Кроме того, как пишет Uchet.kz, постановлением правительства от 31 декабря 2025 года №1204 утверждён перечень товаров, по которым применяются пониженные ставки: в него вошли 242 товарные позиции с кодами ТН ВЭД, а сами ставки действуют при соблюдении условий, включая наличие лицензии и необходимых разрешительных документов.